以下の Makefile では javah や gcc 等のコマンドを使ったヘッダーの生成や、コンパイル・ビルドを「部分的」に自動化しています。「部分的」にという表現には、手動の要素が残されるからです。

まず C 言語のヘッダーの自動生成を行うには、「header_gen」という名称のターゲットを実行します。

$ pwd
/Users/komatsu/JniJnaRepo/HelloJNIPackage/jni
$ ls
makefile
$ make header_gen
javah -verbose -classpath ../target/classes com.book.jni.HelloJNI
[Creating file RegularFileObject[com_book_jni_HelloJNI.h]]
$ ls
com_book_jni_HelloJNI.h
makefile

これでヘッダーファイルの生成ができましたので、「com_book_jni_HelloJNI.c」を作成して、C言語のソースコードを記述します。ここが手動部分に該当します。

ソースコードが完成したら、cc/gcc/clangを使ったビルドの流れを解説します。ビルドには２つのステップがあります。

前者はソースコードのコンパイル、後者はライブラリの生成・ビルドをします。このステップは「all」という名称のターゲットで実行できます。

$ make all
cc -c -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_05.jdk/Contents/Home/include/ -I /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_05.jdk/Contents/Home/include/darwin/ -c com_book_jni_HelloJNI.c -o HelloJNI.o
cc -dynamiclib -o libhello.dylib HelloJNI.o -framework JavaVM -framework OpenCL

これでネイティブライブラリ「libhello.dylib」が生成されます。生成されたファイルは以下のように確認できます。

$ ls
com_book_jni_HelloJNI.c libhello.dylib
HelloJNI.o              com_book_jni_HelloJNI.h makefile

最後にJNIクラスを実行します。

$ cd ../target/classes
$ java com.book.jni.HelloJNI
CL_DEVICE_NAME: Intel(R) Core(TM) i5-3210M CPU @ 2.50GHz
CL_DEVICE_NAME: HD Graphics 4000

このOpenCL実装がサポートデバイスを検索した結果を、標準出力し正常にプログラムが実行されたことが確認できました。

makefileのソースは以下のようになります。

makefile. 

# クラスパスを定義
CLASS_PATH = ../target/classes

# binディレクトリ内の.classファイルの仮想パスを定義
#vpath %.class $(CLASS_PATH)

all : libhello.dylib
        mv libhello.dylib $(CLASS_PATH)

# .dylib（Max OS X）を出力します。
# Windowsの場合は、hello.dll、Linuxの場合は libhello.so
# 出力: libhello.dylib
libhello.dylib : HelloJNI.o
        cc -dynamiclib -o $@ $< -framework JavaVM -framework OpenCL

# 検証環境ではjdk1.8.0_05を使用しています。インクルードパスはjdkバージョンと合わせます。
# 出力：HelloJNI.o
HelloJNI.o : com_book_jni_HelloJNI.c com_book_jni_HelloJNI.h
        cc -c -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_05.jdk/Contents/Home/include/ -I /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_05.jdk/Contents/Home/include/darwin/ -c $< -o $@

# ヘッダーファイルを自動生成します。
# 手動でヘッダーファイルを作る場合はこのステップは不要
# 出力：com_book_jni_HelloJNI.h
header_gen :
        javah -verbose -classpath $(CLASS_PATH) com.book.jni.HelloJNI

clean :
        rm com_book_jni_HelloJNI.h com_book_jni_HelloJNI.c HelloJNI.o $(CLASS_PATH)/libhello.dylib

javac -d target/classes/ src/main/java/com/book/jni/HelloJNI.java

target
├── classes
│   ├── com
│   │   └── book
│   │       └── jni
│   │           └── HelloJNI.class

$ cd target/classes
$ javah -jni com.book.jni.HelloJNI

$ javah -verbose -classpath $(CLASS_PATH) com.book.jni.HelloJNI

gcc -c -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_05.jdk/Contents/Home/include/ -I /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_05.jdk/Contents/Home/include/darwin/ -c com_book_jni_HelloJNI.c -o HelloJNI.o

-I$(JAVA_HOME)/include -I$(JAVA_HOME)/include/linux

gcc -c -I$(JAVA_HOME)/include -I $(JAVA_HOME)/include/linux -c com_book_jni_HelloJNI.c -o HelloJNI.o

"$(JAVA_HOME)\include";
"$(JAVA_HOME)\include\win32"